خرید و دانلود نسخه کامل کتاب The Chemical Master Equation Approach to Nonequilibrium Steady-State of Open Biochemical Systems: Linear Single-Molecule Enzyme Kinetics and Nonlinear Biochemical Reaction Networks

توضیحاتی در مورد کتاب

مقاله علمی. — مجله بین المللی علوم مولکولی، 2010، جلد. 11، ص. 3472-
3500.

ما معادله اصلی تصادفی و شیمیایی را به عنوان رویکردی یکپارچه برای دینامیک سیستم‌های واکنش بیوشیمیایی در یک حجم مزوسکوپی تحت یک موجود زنده توسعه می‌دهیم. محیط. یک محیط زندگی یک ورودی انرژی شیمیایی پیوسته را فراهم می کند که سیستم واکنش را در حالت ثابت غیرتعادلی با نوسانات غلظت حفظ می کند. ما در مورد سینتیک آنزیم تک مولکولی خطی، تک مولکولی، چرخه فسفوریلاسیون-دفسفوریلاسیون (PdPC) با دوپایداری و نوسانات شبکه ای بحث می کنیم. تأکید بر مقایسه بین دینامیک تصادفی و پیش‌بینی مبتنی بر رویکرد سنتی مبتنی بر قانون عمل انبوه است. ما تفاوت بین دوپایداری غیرخطی و دوپایداری تصادفی را معرفی می کنیم، دومی هیچ همتای قطعی ندارد. برای سیستم‌هایی با دوپایداری غیرخطی، سه مقیاس زمانی مختلف وجود دارد: (الف) واکنش‌های بیوشیمیایی فردی، (ب) دینامیک شبکه غیرخطی نزدیک به جاذبه‌ها، و (ج) تکامل سلولی. برای سیستم های مزوسکوپی با اندازه یک سلول زنده، دینامیک در (a) و (c) تصادفی است در حالی که با (b) غالباً قطعی است. هر دو (b) و (c) خواص ظهوری یک شبکه بیوشیمیایی پویا هستند. ما پیشنهاد می کنیم که (c) به فرآیندهای بیوشیمیایی سلولی اصلی مانند تنظیم اپی ژنتیکی، آپوپتوز و ویرایش ایمنی سرطان مرتبط است. تکامل سلولی با انتقال بین جاذبه‌های (b) به شیوه‌ای «تعادل نقطه‌گذاری» پیش می‌رود.