خرید و دانلود نسخه کامل کتاب Metagenomic Data Analysis

توضیحاتی در مورد کتاب



این جلد روش‌ها، خطوط لوله و ابزارهای مختلف توالی‌یابی را برای تجزیه و تحلیل داده‌های متاژنوم توصیف می‌کند. فصل‌ها خوانندگان را از طریق کنترل کیفیت داده‌های توالی خام، پایگاه‌های داده‌های متاژنومیکس برای حاشیه‌نویسی‌های باکتریایی مانند Greengenes، SILVA، RDP و GTDB، راهنمای تجزیه و تحلیل میکروبیوم 16S rRNA و خطوط لوله مانند Mothur، DADA2، QIIME2، تجزیه و تحلیل کل ژنوم تفنگ ساچمه‌ای با استفاده از داده‌های خط لوله MEGAN هدایت می‌کنند. و DIAMOND، خدمات وب مانند PATRIC، RDP، mothur، Kaiju، PhyloPythiaS، MG-RAST، WebMGA، MicrobiomeAnalyst، WHAM!، METAGENassist و MGnify: EBI-Metagenomics، MG-RAST Metagenomics Analysis. سپس فصل‌ها خوانندگان را در مورد رویکردهای توالی‌یابی نسل سوم (TGS) به عنوان توالی‌یابی MinION آگاه می‌کنند و استفاده از پیکربندی ماشین مجازی لینوکس اوبونتو، مقاومت‌های بالینی و محیطی، استفاده از تکنیک‌های FISH و طراحی پروب‌های FISH، پروتکل‌هایی برای متاژنومیکس ویروسی، و دستورالعمل جامع را آموزش می‌دهند. برای تجزیه و تحلیل میکروبیومبا استفاده از بسته های R استفاده می شود. در قالب مجموعه‌های بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی  نوشته شده است، هر فصل شامل مقدمه‌ای بر موضوع، فهرست مواد و روش‌های لازم، شامل نکاتی در مورد عیب‌یابی و مشکلات شناخته شده است. ، و پروتکل های گام به گام و به راحتی قابل تکرار.

معتبر و پیشرفته،  تجزیه و تحلیل داده‌های متاژنومیک: روش‌ها و پروتکل‌ها هدف دارد راهنمای جامعی برای محققین باشد تا در زمینه متاژنومیکس متخصص شوند.

 <. /p>