خرید و دانلود نسخه کامل کتاب Computational Genomics with R

توضیحاتی در مورد کتاب

ژنومیکس محاسباتی با R نقطه شروعی را برای مبتدیان در تجزیه و تحلیل داده های ژنومی فراهم می کند و همچنین متخصصان پیشرفته تر را به سمت تکنیک های پیچیده تجزیه و تحلیل داده ها در ژنومیک راهنمایی می کند. این کتاب موضوعاتی از برنامه نویسی R، یادگیری ماشین و آمار، تا آخرین تکنیک های تجزیه و تحلیل داده های ژنومی را پوشش می دهد. متن اطلاعات و توضیحات قابل دسترسی را ارائه می دهد، همیشه با زمینه ژنومیک در پس زمینه. این همچنین شامل مثال های عملی و مستند در R است تا خوانندگان بتوانند داده های خود را به سادگی با استفاده مجدد از کد ارائه شده تجزیه و تحلیل کنند. از آنجایی که زمینه ژنومیک محاسباتی بین رشته ای است، برای افراد با پیشینه های مختلف به نقاط شروع متفاوتی نیاز دارد. به عنوان مثال، یک زیست شناس ممکن است بخش های مربوط به زیست شناسی ژنوم پایه را نادیده بگیرد و با برنامه نویسی R شروع کند، در حالی که یک دانشمند کامپیوتر ممکن است بخواهد با زیست شناسی ژنوم شروع کند.

پس از خواندن:

• • شما اصول اولیه R را خواهید داشت و می‌توانید درست شیرجه بزنید به استفاده های تخصصی از R برای ژنومیک محاسباتی مانند استفاده از بسته های Bioconductor.
  • شما با آمار، تکنیک های یادگیری تحت نظارت و بدون نظارت که مهم هستند آشنا خواهید شد. در مدل‌سازی داده‌ها و تجزیه و تحلیل اکتشافی داده‌های با ابعاد بالا.
  • شما فواصل ژنومی و عملیات روی آنها را که برای کارهایی مانند استفاده می‌شود، درک خواهید کرد. شمارش خواندن تراز و حاشیه‌نویسی ویژگی ژنومی.
  • شما اصول اولیه پردازش و بررسی کیفیت داده‌های توالی‌یابی پرتوان را خواهید دانست.< /span>
  • شما می‌توانید تجزیه و تحلیل توالی انجام دهید، مانند محاسبه محتوای GC برای بخش‌هایی از ژنوم یا یافتن مکان‌های اتصال فاکتور رونویسی.
  • شما در مورد تکنیک‌های تجسم مورد استفاده در ژنومیک، مانند نقشه‌های حرارتی، نمودارهای متا ژن و تجسم مسیر ژنومی، خواهید دانست.

<. li>شما با تجزیه و تحلیل مجموعه داده های مختلف توالی یابی با کارایی بالا، مانند RNA-seq، ChIP-seq، و BS-seq آشنا خواهید شد.

• شما تکنیک های اساسی برای یکپارچه سازی و تفسیر مجموعه داده های چند omics را می دانید.

آلتونا آکالین یک گروه است. رهبر و رئیس پلتفرم علوم داده های بیوانفورماتیک و Omics در موسسه زیست شناسی سیستم های پزشکی برلین، مرکز ماکس دلبروک، برلین. او از سال 2002 روش‌های محاسباتی را برای تجزیه و تحلیل و ادغام مجموعه‌های داده‌های ژنومیک در مقیاس بزرگ توسعه داده است. چارچوب این کتاب از دوره های سالانه ژنومیک محاسباتی که او از سال 2015 سازماندهی و تدریس کرده است، شکل گرفت.