خرید و دانلود نسخه کامل کتاب Bioinformatics: High Performance Parallel Computer Architectures (Embedded Multi-Core Systems)

توضیحاتی در مورد کتاب

فن‌آوری‌های توالی‌یابی جدید بسیاری از موانع تجربی را برای توالی‌یابی مقیاس ژنوم شکسته‌اند و منجر به استخراج مقادیر زیادی از داده‌های توالی شده است. این گسترش پایگاه‌های اطلاعاتی بیولوژیکی نیاز به راه‌های جدیدی را برای مهار و استفاده از مقدار شگفت‌انگیز اطلاعات ژنومی موجود و تبدیل آن به درک بیولوژیکی اساسی ایجاد کرد. مجموعه‌ای از رویکردهای اخیر محققان برجسته، Bioinformatics: High Performance Parallel Computer Architectures درباره چگونگی بهره‌گیری از برنامه‌ها و الگوریتم‌های بیوانفورماتیک در انواع معماری‌های موازی مدرن بحث می‌کند. دو عامل به استفاده روزافزون از معماری‌های موازی کامپیوتری مدرن برای رسیدگی به مشکلات زیست‌شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک ادامه می‌دهند: تکنیک‌های با توان بالا برای توالی‌یابی DNA و تجزیه و تحلیل بیان ژن – که منجر به رشد تصاعدی در مقدار داده‌های بیولوژیکی دیجیتال شده است – و انقلاب چند هسته ای و چند هسته ای در معماری کامپیوتر. این کتاب با ارائه اطلاعات کلیدی در مورد نحوه استفاده بهینه از معماری‌های موازی: الگوریتم‌ها و ابزارهایی از جمله هم‌ترازی توالی زوجی، هم‌ترازی توالی چندگانه، BLAST، یافتن موتیف، تطبیق الگو، مونتاژ توالی، مدل‌های پنهان مارکوف، پروتئومیکس و بازسازی درخت تکاملی را شرح می‌دهد. آدرس‌دهی به فناوری GPGPU و مدل برنامه‌نویسی CUDA با رشته‌های انبوه مرتبط بررسی معماری و برنامه‌نویسی FPGA چندین الگوریتم موازی را برای محاسبه هم‌ترازی‌ها در معماری Cell/BE ارائه می‌کند، از جمله هم‌ترازی زوجی در فضای خطی، هم‌ترازی ترکیبی، و هم‌ترازی پیوندی ارزیابی و پیشرفت در مفاهیم و مفاهیم اساسی تابع درستنمایی فیلوژنتیک در معماری‌های موازی کامپیوتر (از FPGA تا ابررایانه IBM BlueGene/L) چندین تکنیک مؤثر را برای بهره‌برداری کامل از قابلیت محاسباتی پردازنده‌های گرافیکی دارای هسته‌های متعدد CUDA برای تسریع جستجوی پایگاه‌داده توالی پروتئین، هم‌ترازی توالی‌های متعدد و پیدا کردن موتیف یک روش موازی مبتنی بر CUDA را برای تصحیح خطاهای جفت پایه توالی در داده‌های HTSR توضیح می‌دهد از آنجایی که میزان داده‌های توالی موجود در دسترس عموم سریع‌تر از سرعت عملکرد هسته تک پردازنده رشد می‌کند، ابزارهای بیوانفورماتیک مدرن باید از معماری‌های موازی رایانه استفاده کنند. اکنون که دوران پردازنده‌های چند هسته‌ای آغاز شده است، انتظار می‌رود که پردازنده‌های اصلی آینده، سیستم‌های موازی باشند. این کتاب برای هر کسی که فعالانه در تحقیقات و برنامه‌های کاربردی مشارکت دارد مفید است، به شما کمک می‌کند تا از این ابزارها حداکثر بهره را ببرید و راه‌حل‌های HPC بهینه برای بیوانفورماتیک ایجاد کنید.